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通用多基因标记可能彻底改变生物多样性研究

2022-12-14 15:11:48健康专一的悟空

由波恩 Koenig 博物馆(莱布尼茨生物多样性变化分析研究所)的科学家领导的国际团队首次成功测试了一组通用基因,用于对不同动物物种进行系

由波恩 Koenig 博物馆(莱布尼茨生物多样性变化分析研究所)的科学家领导的国际团队首次成功测试了一组通用基因,用于对不同动物物种进行系统表征。他们的工作发表在《生态学与进化方法》上。

通用多基因标记可能彻底改变生物多样性研究

迄今为止用于生物多样性分子记录的许多方法仍然经常存在缺陷,因为它们仅使用一个遗传标记,这通常不能在基因组水平上正确反映物种和遗传模式。

其他基于基因组数据的分析不适合全面的生物多样性研究,因为它们不够普遍,而且往往不是很可持续,因为它们基于无法与其他研究结果相结合的数据。

被测试的基因集,更准确地称为“后生动物级通用单拷贝直系同源物”(后生动物 USCOs),包含数百个核基因,可用于所有多细胞动物。该方法明显掩盖了 DNA 条形码,这是目前通常用于物种鉴定并广泛用于生态监测的方法。

到目前为止,USCO 已被用于检查基因组测序的完整性和质量。由科尼希博物馆的甲虫研究员和馆藏馆长德克·阿伦斯领导的工作组现在已经首次成功地使用这种方法来分离用传统 DNA 条形码无法区分的神秘物种。

该方法在蜘蛛、蜈蚣、青蛙、甲虫、苍蝇、小型寄生蜂和蝴蝶身上进行了测试。这些新的 USCO 标记既可以通过靶向测序获得,也可以通过从已经发表并在数据库中可用的基因组数据中提取获得。这使得新方法可持续且成功。

虽然目前比传统的遗传条形码更昂贵,但作者建议后生动物 USCO 主要作为更复杂病例的额外选择方法。其中有很多,特别是因为科学还没有就现在有多少物种居住在地球上达成一致;估计有 200 万到 20 亿种物种。

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