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研究人员评估用于霉菌鉴定的质谱方法

2023-01-17 14:12:30健康专一的悟空

近年来,丝状真菌或霉菌已成为免疫功能低下个体感染危及生命的潜在病原体。这些感染的及时管理需要在临床环境中快速准确地诊断霉菌。不幸的

近年来,丝状真菌或霉菌已成为免疫功能低下个体感染危及生命的潜在病原体。这些感染的及时管理需要在临床环境中快速准确地诊断霉菌。

研究人员评估用于霉菌鉴定的质谱方法

不幸的是,传统方法非常耗时,因为培养和检查霉菌需要很长的潜伏期。另一方面,先进的分子技术更加灵敏和高效。

一种可以高灵敏度和重现性地检测丝状真菌分离物的技术是基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱法(MALDI-TOFMS)。它可以根据质量和电荷的变化区分样品。然而,由于数据库可用性的限制和缺乏标准化程序,它没有被广泛使用。

最近,由Mi-KyungLee教授领导的韩国中央大学的一组研究人员评估了国内临床环境中用于鉴定霉菌的三种不同MALDI-TOFMS方法。

在他们于2022年10月26日发表在《临床微生物学杂志》上的研究中,他们比较了BrukerBiotyper、ASTAMicroIDSys和VitekMS的性能和诊断准确性。他们还使用84种丝状真菌分离物评估了三种预处理方法(“直接”、“平板”和“管内”)的敏感性。

在解释他们研究背后的基本原理时,Lee教授说:“选择合适的样品制备方法可以提高霉菌识别的效率和准确性。此外,在诊断层面开发系统化流程最终可以为患者提供有效的治疗。”

该研究发现,BrukerBiotyper可正确识别71.43%的分离株,直至种或属水平,而ASTAMicroIDSys和VitekMS的准确率分别为70.24%和55.95%。此外,由于其简单易用,样品制备的直接方法优于其他两种方法。值得注意的是,不同样品制备方法的鉴定灵敏度没有显着差异。

错误识别率是临床实验室的一个重要考虑因素,因为它可能导致对患者进行不适当的治疗干预。在这项研究中,只有一个分离株被错误识别,使用Vitek-MS和板上方法。此外,通过Vitek-MS,曲霉菌(一种高度流行且具有临床意义的微生物)的物种水平鉴定最高,表明该技术在临床环境中的适用性。

通过BrukerBiotyper、ASTAMicroIDSys和VitekMS错误识别的物种数量分别为17、15和23。如果由于图书馆中缺少某些物种而不是错误而导致错误识别,该团队建议需要进行额外的评估。此外,该团队确定,任何敏感性差异都可归因于系统数据库的差异。

总之,MALDI-TOFMS是一种有价值的技术,可以准确及时地识别具有临床意义的微生物。可应用于广泛物种的过程标准化和指南有助于减少通过这些技术发生的过程偏差。此外,与采集参数、矩阵质量和硬件相关的限制需要进一步评估。

当被问及这项研究的应用时,Lee教授说:“我们的研究首次比较了三种MALDI-TOFMS仪器的灵敏度和准确性,以及三种预处理方法对丝状真菌鉴定的功效。获得了准确的结果通过使用MALDI-TOFMS进行霉菌鉴定的简单而简化的流程,可以提高用户的实验室工作效率和患者的治疗效率。”

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