野生蓝莓端粒到端粒无间隙参考基因组的第一份报告

蓝莓是一种常见的越橘 属植物，浆果个头较小，以其味道鲜美、甜酸平衡、营养成分丰富而闻名。它富含多种维生素和抗氧化剂。然而，栽培蓝莓遗传资源有限，严重阻碍了其开发利用。因此，利用野生蓝莓遗传资源进行育种对于提高栽培品种的抗逆力和品质至关重要。

越橘(Vaccinium duclouxii)原产于中国西南地区，是一种特有的野生蓝莓品种，具有很高的营养、药用和观赏价值。它还表现出很强的抵抗力和环境适应能力。然而，高质量基因组的缺乏严重制约了其应用和发展。

2023年10月， 园艺研究 发表了题为“野生蓝莓(Vaccinium duclouxii)的端粒到端粒间隙参考基因组提供其高可溶性糖和花青素积累”的观点。

本研究采用 PacBio HiFi、ONT 超长和 Hi-C 测序数据对 V. duclouxii 基因组进行端粒到端粒 (T2T) 从头组装。组装后的基因组大小为573.67 Mb，成功捕获了所有12条无间隙染色体，总共注释了41,953个基因。重复序列占54.84%，产生了越橘属最完整、高质量的基因组。通过整合转录组学和代谢组学分析，该研究揭示了V. duclouxii成熟过程中糖和酸积累以及花青素生物合成的分子机制。这项研究为了解越橘属的进化奠定了基础 ，并为未来蓝莓的遗传改良和育种工作提供了宝贵的见解。