这些科学家从为13000名俄勒冈人免费提供基因筛查中学到了什么

早期基因检测可以改善癌症结果，但如果个人缺乏家族史或无力承担检测费用，他们通常不会接受这种筛查。俄勒冈健康与科学大学的一个临床实验室团队希望通过向俄勒冈州地址的所有成年人提供针对遗传性癌症和家族性高胆固醇血症的免费基因筛查来改变该州居民的现状。自2018年以来，该团队对 13,000 多名俄勒冈人进行了筛查，并于 7 月 27 日在《人类遗传学杂志》上介绍了他们的方法、发现和经验教训。

“我们希望这真的可以成为其他想要进行低成本人口筛查的州的典范，”第一作者、奈特诊断实验室的科学家蒂莫西·奥布莱恩 (Timothy O'Brien) 说。“我们提供了一种路线图，未来的筛选项目可以关注我们，看看哪些是有效的，哪些是可以改进的。”

该团队通过社交媒体广告和在农贸市场等活动中的展示来招募参与者。他们甚至设立了自动售货机，人们可以在那里取回并归还收集漱口水唾液样本的测试套件。COVID-19 大流行爆发后，个人可以通过邮寄申请检测套件。一旦参与者通过符合 HIPAA 标准的应用程序表示同意，样本就会在临床实验室进行处理，以筛选 31 个与遗传性癌症相关的基因和 1 个与家族性高胆固醇血症相关的基因中的致病变异。

“我们想要报告任何被认为可采取行动的致病变异，这意味着你可以采取一些措施，”资深作者、俄勒冈健康与科学大学分子与医学遗传学名誉教授 Sue Richards 说。“这可能是改变你的筛查习惯、采取预防性手术或药物，或者咨询你的临床医生。”

13,000 多名参与者中，有 710 人的致病变异筛查结果呈阳性。所有获得阳性结果的参与者都接到了遗传咨询师的电话，解释他们的结果、结果如何影响他们的疾病风险以及医疗管理建议。“遗传咨询对于这个项目至关重要，”理查兹说。“公众要理解这些基因检测报告并不容易，因为它们相当技术性，重要的是要理解，仅仅因为他们携带致病变异可能并不意味着他们会患上这种类型的癌症。咨询师不仅会与他们谈论他们自己的健康和家族史，还会与他们谈论如何将这些信息传递给其他家庭成员，因为他们也面临着携带这种变异的风险。”

当实验室团队第一次启动这个项目时，他们必须将实验室的基因检测工作流程扩大到原来容量的十倍左右，重点关注一组选定的致病变异，并利用机器人的帮助来执行更繁琐的任务。这使得该小组每月可以由一名实验室技术人员处理多达 1,000 个样本，预计每位参与者的成本为 50 美元。为了减少实验室混淆导致假阳性的可能性，所有结果呈阳性的参与者都被要求使用不同的基因测序方法进行二次筛查。即便如此，研究人员报告称，在他们测序的 20,000 个样本中，临床相关样本的混淆为零。

根据测序结果，研究人员还收集了大量数据，可用于分析俄勒冈州人口的遗传风险因素并进行其他研究。大约 5% 的参与者筛查出致病遗传性癌症变异呈阳性，这一数字高于之前几项人群筛查研究报告的水平，可能是因为有个人或家族癌症史的人更有可能寻求检测。

这种高于预期的患病率也可能是因为之前的研究筛选了一组不同的基因。医学遗传学和基因组学学院 (ACMG) 详细介绍了一组与个人状况无关的最小基因，但建议对正在进行临床测试的基因进行分析。然而，如果研究人员仅检查此列表中的基因，他们将错过研究人群中 59% 的致病变异。此外，研究中检测到的最常见的致病变异并不在 ACMG 的列表中。这凸显了扩大被测试基因的范围如何对有多少人在大型筛查研究中获得阳性结果产生重大影响。

该团队计划在未来继续他们的筛查计划，并加大力度接触更多样化的参与者。目前，76% 的研究参与者是女性，因此该研究正在研究如何招募更多男性参与者。此外，通过将他们的同意应用程序翻译成西班牙语，研究人员计划覆盖更多俄勒冈州的西班牙语人口。

“该项目的总体目标实际上是帮助俄勒冈人并为他们提供这些健康信息，”奥布莱恩说。“我们觉得我们已经能够实现这一目标，并希望这在未来继续成为俄勒冈人健康的有力支持者。”